ПИШ «Агробиотек» ТГУ запускает программу по подготовке «биопрограммистов»
ХХI век называют веком биологии, поскольку в этой области происходит наибольшее количество прорывных открытий. Во многом это обусловлено развитием биоинформатики – направления, которое включает разработку методов для анализа больших массивов биологических данных. В сентябре на базе Передовой инженерной школы «Агробиотек» Томского государственного университета стартует новая программа, в рамках которой будет осуществляться подготовка биоинформатиков. Эти специалисты смогут решать биологические задачи вычислительными методами, чтобы создавать новые технологии в биомедицине, сельском хозяйстве и других областях.
– Современная биология имеет дело с огромным количеством данных, например, геномы бактерий состоят из миллионов нуклеотидов, а ДНК человека – из трех миллиардов нуклеотидов. Проанализировать вручную их можно, но на это уйдут десятилетия, и ещё столько же на то, чтобы найти нужный участок гена, – говорит директор образовательного центра Передовой инженерной школы ТГУ «Агробиотек» Екатерина Бойко. – Решать такие задачи в сотни и даже тысячи раз быстрее позволяет биоинформатика, которая объединяет биологию, информатику, статистику для изучения биологических данных.
В качестве примера учёный приводит геном человека. Он был прочитан двадцать лет назад, но «прочитан» не означает «понят». Чтобы сделать выводы, необходима статистика и анализ сотен тысяч человеческих геномов, результаты которого позволят выявить закономерности, вычислить, какие изменения в геноме могут приводить к тем или иным заболеваниям, как найти способ предотвратить или исправить генетическую поломку.
В последнее время здравоохранение, биология, биотехнология, фармацевтическая промышленность, экология и сельское хозяйство стали в большей степени зависимыми от сложного анализа исследовательских данных и искусственного интеллекта. Поэтому потребность в экспертах, обладающих компетенциями одновременно в области биологии, математики, статистики и машинного обучения, продолжает расти.
– В нашей программе «Биоинформатика» есть два профессиональных трека – это клиническая биоинформатика и селекция, – рассказывает Екатерина Бойко. – Но основные инструменты даются как обязательные дисциплины. То, что связано с информационными технологиями, дают информатики (программирование на Python, введение в Linux), а биологические дисциплины – классические биологи (молекулярная биология, сигнальные пути в клетках). Дисциплины на стыке наук преподают практикующие биоинформатики (биостатистика в R, омиксные технологии, анализ геномных данных, белковая инженерия).
Среди преподавателей будут специалисты из ТГУ, СПбГУ и молекулярно-генетической лаборатории ООО «БИОТРОФ». Программа, по словам разработчиков, подходит для студентов биологических и медицинских специальностей, у которых есть знания генетики и клеточной биологии, молекулярных механизмов хранения, передачи и изменения наследственной информации.
Выпускники смогут реализовать свои знания и потенциал в разных областях – от разработки подходов для диагностики и препаратов для лечения тяжёлых наследственных заболеваний, онкологии, других тяжёлых недугов до создания новых сортов растений и восстановления окружающей среды.